Soutenance de thèse en Informatique

Florian ROBERT, Équipe 06 Méthodes et Innovations pour la Recherche sur les Cancers de l’Enfant.

Co-direction de thèse : Christophe Grosset (BRIC) et Baudouin Denis de Senneville (IMB- Institut des Mathématiques de Bordeaux)

Lundi 29 septembre, 14h

“Exploration de l’organisation interne des tissus tumoraux par imagerie volumétrique, méthodes numériques et apprentissage profond.”

Salle des Actes bâtiment A33 campus Sciences et Technologies à Talence

Résumé :

Comprendre l’organisation interne des tissus tumoraux est essentiel pour améliorer les traitements contre le cancer chez l’enfant. Cette thèse se concentre sur l’hépatoblastome, la tumeur hépatique maligne la plus fréquente chez l’enfant. A partir d’images 3D obtenues par microscopie électronique, un jumeau numérique du tissu tumoral a été élaboré à l’aide d’outils innovants permettant de segmenter et d’identifier automatiquement les structures biologiques comme les cellules, les noyaux ou les capillaires sanguins. Ces informations ont ensuite permis d’analyser l’organisation interne du tissu à l’aide de méthodes d’apprentissage non supervisé. Ce travail ouvre la voie à une meilleure compréhension de l’architecture des tumeurs, et à terme, a pour objectif d’améliorer le diagnostic, choisir le meilleur traitement et mieux prendre en charge les enfants atteints de cancer.

Membres du jury :

Mme. Karin PERNET GALLAY, Ingénieure de Recherche, Université de Grenoble Alpes, Rapporteuse
M. Charles KERVRANN, Directeur de Recherche, Université de Rennes, Rapporteur
Mme. Nataliya SOKOLOVSKA, Profresseure des Universités, Sorbonne Université, Examinatrice
Mme. Christèle ETCHEGARAY, Chargée de Recherche, Université de Bordeaux, Examinatrice
M. Baudouin DENIS DE SENNEVILLE, Directeur de Recherche, Université de Bordeaux, Directeur
M. Christophe F. GROSSET, Directeur de Recherche, Université de Bordeaux, Co-Directeur